MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 162068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	AGC	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
2	NC_014931	CGA	2	6	204	209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
3	NC_014931	CGC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790695
4	NC_014931	CTC	2	6	341	346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790695
5	NC_014931	TGA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790695
6	NC_014931	CTGCCG	2	12	431	442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319790695
7	NC_014931	GC	4	8	511	518	0 %	0 %	50 %	50 %	319790695
8	NC_014931	CGC	3	9	516	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790695
9	NC_014931	CGG	2	6	576	581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790695
10	NC_014931	GCT	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790695
11	NC_014931	CTCG	2	8	744	751	0 %	25 %	25 %	50 %	319790695
12	NC_014931	CGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
13	NC_014931	TTC	2	6	778	783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790695
14	NC_014931	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790695
15	NC_014931	CGCA	2	8	796	803	25 %	0 %	25 %	50 %	319790695
16	NC_014931	GAA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790695
17	NC_014931	TTC	2	6	811	816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790695
18	NC_014931	AAG	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790695
19	NC_014931	TGA	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790695
20	NC_014931	GCC	2	6	948	953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790695
21	NC_014931	CAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790695
22	NC_014931	GC	4	8	991	998	0 %	0 %	50 %	50 %	319790695
23	NC_014931	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790695
24	NC_014931	CTG	2	6	1159	1164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790695
25	NC_014931	AGA	2	6	1202	1207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790695
26	NC_014931	ACT	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790695
27	NC_014931	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	319790695
28	NC_014931	CGG	2	6	1350	1355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790695
29	NC_014931	ACG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
30	NC_014931	TGC	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790695
31	NC_014931	CAG	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
32	NC_014931	CAG	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
33	NC_014931	TCG	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790696
34	NC_014931	GCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
35	NC_014931	CGG	2	6	1672	1677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
36	NC_014931	CCAGCT	2	12	1678	1689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319790696
37	NC_014931	ACC	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790696
38	NC_014931	CAC	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790696
39	NC_014931	CGG	2	6	1735	1740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
40	NC_014931	CGA	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790696
41	NC_014931	CAC	3	9	1756	1764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790696
42	NC_014931	GC	4	8	1770	1777	0 %	0 %	50 %	50 %	319790696
43	NC_014931	GCCG	2	8	1804	1811	0 %	0 %	50 %	50 %	319790696
44	NC_014931	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
45	NC_014931	CCG	2	6	1893	1898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790696
46	NC_014931	GCC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790696
47	NC_014931	CTA	2	6	2017	2022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790696
48	NC_014931	GCAA	2	8	2052	2059	50 %	0 %	25 %	25 %	319790696
49	NC_014931	AAG	2	6	2133	2138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790696
50	NC_014931	CCT	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790696
51	NC_014931	AAC	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790696
52	NC_014931	CGG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
53	NC_014931	GAA	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790696
54	NC_014931	CG	3	6	2339	2344	0 %	0 %	50 %	50 %	319790696
55	NC_014931	GCATC	2	10	2433	2442	20 %	20 %	20 %	40 %	319790696
56	NC_014931	AAC	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790696
57	NC_014931	GAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790696
58	NC_014931	CGG	2	6	2491	2496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
59	NC_014931	ACCT	2	8	2525	2532	25 %	25 %	0 %	50 %	319790696
60	NC_014931	CGT	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790696
61	NC_014931	AGA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790697
62	NC_014931	GTC	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
63	NC_014931	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
64	NC_014931	GGCC	2	8	3043	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
65	NC_014931	CGA	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
66	NC_014931	TCG	2	6	3063	3068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
67	NC_014931	GAC	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
68	NC_014931	GCC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
69	NC_014931	GGC	2	6	3200	3205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
70	NC_014931	GGC	2	6	3236	3241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
71	NC_014931	GGCGTG	2	12	3248	3259	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319790697
72	NC_014931	ATC	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
73	NC_014931	AAC	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790697
74	NC_014931	GAGCT	2	10	3512	3521	20 %	20 %	40 %	20 %	319790697
75	NC_014931	AAC	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790697
76	NC_014931	CTG	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
77	NC_014931	GAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
78	NC_014931	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
79	NC_014931	TCA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
80	NC_014931	GCCG	2	8	3676	3683	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
81	NC_014931	CGG	2	6	3691	3696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
82	NC_014931	GCAC	2	8	3705	3712	25 %	0 %	25 %	50 %	319790697
83	NC_014931	CAA	2	6	3775	3780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790697
84	NC_014931	CGG	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
85	NC_014931	GC	3	6	3820	3825	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
86	NC_014931	TCA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
87	NC_014931	A	6	6	3875	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	319790697
88	NC_014931	CGA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
89	NC_014931	TGC	2	6	3923	3928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
90	NC_014931	CCAG	2	8	3963	3970	25 %	0 %	25 %	50 %	319790697
91	NC_014931	GC	4	8	4000	4007	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
92	NC_014931	TCG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
93	NC_014931	GCC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
94	NC_014931	ACG	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
95	NC_014931	ATC	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
96	NC_014931	TCG	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
97	NC_014931	GCC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
98	NC_014931	GCC	2	6	4115	4120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
99	NC_014931	CGC	2	6	4142	4147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
100	NC_014931	TGG	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790697
101	NC_014931	CCG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
102	NC_014931	GC	3	6	4331	4336	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
103	NC_014931	GCT	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
104	NC_014931	GAT	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790697
105	NC_014931	CGA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
106	NC_014931	CGA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
107	NC_014931	ACC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790697
108	NC_014931	CAT	4	12	4471	4482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
109	NC_014931	CCGACG	2	12	4485	4496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319790697
110	NC_014931	GCT	3	9	4519	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
111	NC_014931	CTT	2	6	4531	4536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790697
112	NC_014931	GCC	2	6	4588	4593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
113	NC_014931	GC	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
114	NC_014931	CGG	2	6	4699	4704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
115	NC_014931	GC	3	6	4748	4753	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
116	NC_014931	GC	3	6	4781	4786	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
117	NC_014931	GC	3	6	4816	4821	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
118	NC_014931	CGCC	2	8	4857	4864	0 %	0 %	25 %	75 %	319790697
119	NC_014931	GCC	3	9	4983	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
120	NC_014931	AGC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
121	NC_014931	AGC	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
122	NC_014931	GC	3	6	5103	5108	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
123	NC_014931	GCG	2	6	5118	5123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
124	NC_014931	GC	3	6	5131	5136	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
125	NC_014931	GAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790697
126	NC_014931	CGA	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
127	NC_014931	TCA	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
128	NC_014931	AGC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
129	NC_014931	ACC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790697
130	NC_014931	GCC	2	6	5283	5288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
131	NC_014931	CGA	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
132	NC_014931	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
133	NC_014931	GCGG	2	8	5395	5402	0 %	0 %	75 %	25 %	319790697
134	NC_014931	GAGC	2	8	5418	5425	25 %	0 %	50 %	25 %	319790697
135	NC_014931	CAACC	2	10	6092	6101	40 %	0 %	0 %	60 %	319790698
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139	NC_014931	TTGCTG	2	12	6265	6276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319790698
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153	NC_014931	CCCG	2	8	6839	6846	0 %	0 %	25 %	75 %	319790699
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251	NC_014931	GA	3	6	10727	10732	50 %	0 %	50 %	0 %	319790704
252	NC_014931	GAC	2	6	10858	10863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790704
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255	NC_014931	AAG	2	6	11113	11118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790704
256	NC_014931	CCTGCG	2	12	11139	11150	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319790704
257	NC_014931	CTAGG	2	10	11166	11175	20 %	20 %	40 %	20 %	319790704
258	NC_014931	CGA	2	6	11199	11204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790705
259	NC_014931	GCG	2	6	11213	11218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790705
260	NC_014931	GCA	2	6	11266	11271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790705
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262	NC_014931	CAG	2	6	11306	11311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790705
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393	NC_014931	CTT	2	6	16074	16079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790710
394	NC_014931	CGTG	2	8	16082	16089	0 %	25 %	50 %	25 %	319790710
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490	NC_014931	GCC	3	9	20228	20236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
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496	NC_014931	GCC	3	9	20435	20443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
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498	NC_014931	CAG	2	6	20587	20592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790714
499	NC_014931	GCT	2	6	20601	20606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790714
500	NC_014931	TGC	2	6	20616	20621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790714

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